А в айпаде случайне не стоит ли "не оставлять письма на сервере"? Или если заходишь сначала с него, то и пометка письму ставится, что оно уже прочитано, паоэтому на комп и не поступает уведомление о новом письме. Получается как бы какой агент раньше зашел, того и письма.